Prof. dr hab. Agata Stanek została prezesem Polskiego Towarzystwa Angiologicznego. Wyboru na funkcję prezesa towarzystwa na kadencję 2024–2026 dokonano podczas XVI Kongresu Polskiego Towarzystwa Angiologicznego, który odbył się w dniach 22-23 marca 2024 r.
Prof. dr hab. Agata Stanek dotychczas pełniła funkcję Prezesa Elekta. Dotychczasowym prezesem Towarzystwa był prof. dr hab. n. med. Grzegorz Madycki. Według statutu PTA, kadencja prezesa jest dwuletnia (2024 – 2026).
Prof. dr hab. Agata Stanek jest również przedstawicielem Polskiego Towarzystwa Angiologicznego w European Society for Vascular Medicine oraz członkiem Państwowej Akademii Nauk, Komitetu Nauk Medycznych oraz Komitetu Fizyki Medycznej, Radiobiologii i Diagnostyki Obrazowej na kadencję 2024–2028.